Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms