Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc110Q3V125 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc110Q3V125 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms