Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim80Q3V061 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim80Q3V061 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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