Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pfdn4Q3UWL8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pfdn4Q3UWL8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pfdn4Q3UWL8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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