Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm28047Q3US59 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm28047Q3US59 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm28047Q3US59 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm28047Q3US59 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm28047Q3US59 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm28047Q3US59 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm28047Q3US59 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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