Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp19Q3UJD6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms