Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm648Q3UJ22 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm648Q3UJ22 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms