Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms