Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc174Q3U155 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc174Q3U155 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms