Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms