Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms