Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

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Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnnm2Q3TWN3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms