Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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