Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms