Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms