Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms