Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Spatc1Q148B6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Spatc1Q148B6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms