Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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