Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms