Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chd8Q09XV5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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