Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms