Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
F13bQ07968 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms