Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms