Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrx2Q06348 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms