Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms