Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nf1Q04690 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms