Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kcnb1Q03717 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kcnb1Q03717 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kcnb1Q03717 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms