Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms