Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb5Q02739 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms