Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
GscQ02591 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GscQ02591 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms