Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms