Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms