Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax8Q00288 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms