Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb4P99026 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms