Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms