Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms