Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irx1P81068 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irx1P81068 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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