Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad50P70388 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad50P70388 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms