Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx3P70354 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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