Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SbdsP70122 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms