Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps11P62281 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rps11P62281 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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