Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itga11P61622 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms