Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms