Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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