Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms