Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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