Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec1P51908 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms