Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CenpcP49452 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CenpcP49452 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CenpcP49452 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms