Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrprbP47758 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrprbP47758 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrprbP47758 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms