Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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